Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
AtrQ9JKK8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
AtrQ9JKK8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms