Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Stx6Q9JKK1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms