Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Nectin1Q9JKF6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms