Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms