Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PigbQ9JJQ0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PigbQ9JJQ0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms