Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnnbip1Q9JJN6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms