Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc86Q9JJ89 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms