Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpf2Q9JJ80 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms