Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smad9Q9JIW5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms