Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pus3Q9JI38 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms