Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
RabggtaQ9JHK4 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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