Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tcirg1Q9JHF5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms