Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Cldn19Q9ET38 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn19Q9ET38 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn19Q9ET38 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Cldn19Q9ET38 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn19Q9ET38 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn19Q9ET38 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn19Q9ET38 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn19Q9ET38 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn19Q9ET38 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Cldn19Q9ET38 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn19Q9ET38 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cldn19Q9ET38 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Cldn19Q9ET38 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Cldn19Q9ET38 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn19Q9ET38 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn19Q9ET38 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cldn19Q9ET38 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Cldn19Q9ET38 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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Cldn19Q9ET38 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Cldn19Q9ET38 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cldn19Q9ET38 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms