Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tlr9Q9EQU3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tlr9Q9EQU3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms