Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Cpsf1Q9EPU4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cpsf1Q9EPU4 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms