Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap1Q9EPJ9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms