Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP93

Vmn1r53, Vomeronasal type-1 receptor 53, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r53Q9EP93 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r53Q9EP93 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r53Q9EP93 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms