Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bap18Q9DCT6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms