Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT5

Sdf2, Stromal cell-derived factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdf2Q9DCT5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sdf2Q9DCT5 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sdf2Q9DCT5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms