Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Pop7Q9DCH2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pop7Q9DCH2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Pop7Q9DCH2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Pop7Q9DCH2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Pop7Q9DCH2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Pop7Q9DCH2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Pop7Q9DCH2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Pop7Q9DCH2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pop7Q9DCH2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms