Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Csnk1dQ9DC28 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Csnk1dQ9DC28 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Csnk1dQ9DC28 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Csnk1dQ9DC28 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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