Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rnf6Q9DBU5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms