Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc97Q9DBT3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms