Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fundc1Q9DB70 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms