Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAV9

Tmem38b, Trimeric intracellular cation channel type B, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38bQ9DAV9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem38bQ9DAV9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms