Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D9S1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D9S1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D9S1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q9D9S1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D9S1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D9S1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D9S1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D9S1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Q9D9S1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms