Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H2

Cldnd2, Claudin domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd2Q9D9H2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cldnd2Q9D9H2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cldnd2Q9D9H2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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