Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cntd1Q9D995 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cntd1Q9D995 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms