Protein–RNA interactions for Protein: Q9D902

Gtf2e2, General transcription factor IIE subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e2Q9D902 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gtf2e2Q9D902 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gtf2e2Q9D902 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms