Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Snx5Q9D8U8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms