Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U2

Tmem41a, Transmembrane protein 41A, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem41aQ9D8U2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tmem41aQ9D8U2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem41aQ9D8U2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem41aQ9D8U2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem41aQ9D8U2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem41aQ9D8U2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem41aQ9D8U2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem41aQ9D8U2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem41aQ9D8U2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem41aQ9D8U2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem41aQ9D8U2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem41aQ9D8U2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem41aQ9D8U2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem41aQ9D8U2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem41aQ9D8U2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem41aQ9D8U2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem41aQ9D8U2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem41aQ9D8U2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmem41aQ9D8U2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem41aQ9D8U2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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