Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tvp23bQ9D8T4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tvp23bQ9D8T4 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms