Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rexo2Q9D8S4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms