Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Chmp4bQ9D8B3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms