Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
U2af1Q9D883 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
U2af1Q9D883 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms