Protein–RNA interactions for Protein: Q9D869

Chp2, Calcineurin B homologous protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chp2Q9D869 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Chp2Q9D869 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Chp2Q9D869 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Chp2Q9D869 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Chp2Q9D869 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chp2Q9D869 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms