Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Fip1l1Q9D824 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Fip1l1Q9D824 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms