Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cldn22Q9D7U6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cldn22Q9D7U6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms