Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmem54Q9D7S1 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Tmem54Q9D7S1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmem54Q9D7S1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmem54Q9D7S1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
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Tmem54Q9D7S1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmem54Q9D7S1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Tmem54Q9D7S1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Tmem54Q9D7S1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmem54Q9D7S1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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