Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfsf13Q9D777 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tnfsf13Q9D777 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms