Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gbe1Q9D6Y9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms