Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc52a3Q9D6X5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms