Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cmtm5Q9D6G9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cmtm5Q9D6G9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms