Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tubb4aQ9D6F9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tubb4aQ9D6F9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms