Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Ptp4a3Q9D658 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ptp4a3Q9D658 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms