Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc39Q9D5Y1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms