Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc81Q9D5W4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc81Q9D5W4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms