Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Lpcat2bQ9D5U0 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms