Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Speer4f1Q9D5Q6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Speer4f1Q9D5Q6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms