Protein–RNA interactions for Protein: Q9D548

Zcchc13, Cellular nucleic acid binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc13Q9D548 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Zcchc13Q9D548 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Zcchc13Q9D548 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms